Dalam satu pendekatan yang dikembangkan oleh tim Baker, yang disebut halusinasi, peneliti memasukkan urutan asam amino acak ke dalam jaringan prediksi struktur; ini mengubah struktur sehingga menjadi lebih seperti protein, seperti yang dinilai oleh prediksi jaringan.
Dalam makalah tahun 2021, tim Baker menciptakan lebih dari 100 protein 'halusinasi' kecil di laboratorium dan menemukan tanda-tanda bahwa sekitar seperlima menyerupai bentuk yang diprediksi.
AlphaFold, dan alat serupa yang dikembangkan oleh lab Baker bernama RoseTTAFold, dilatih untuk memprediksi struktur rantai protein individu. Tetapi para peneliti segera menemukan bahwa jaringan semacam itu juga dapat memodelkan kumpulan beberapa protein yang berinteraksi.
Atas dasar ini, Baker dan timnya yakin mereka bisa berhalusinasi protein yang akan merakit diri menjadi nanopartikel dari berbagai bentuk dan ukuran; ini akan terdiri dari banyak salinan protein tunggal dan akan serupa dengan yang menjadi dasar vaksin COVID-19. ***
